多宝鱼没有明确相克的食物，但多宝鱼属于海洋生物，属性寒凉，尽量不要和生冷的食物一起食用，以免出现腹痛、腹泻等症状。
食用多宝鱼禁忌：
结核患者禁食。结核患者如果在服用异烟肼时食用多宝鱼，容易发生过敏反应，轻者出现恶心、头痛、皮肤潮红、眼结膜充血等症状，严重是则会出现心悸、口唇及面部麻胀、皮疹、腹泻、腹痛、呼吸困难、血压升高，甚至会危机生命。
肝硬化患者禁食。肝硬化时机体难以产生凝血因子，加之血小板偏低，轻易引起出血，如果再食用多宝鱼，会使病情急剧恶化。
出血性疾病患者禁食。患有血小板减少、血友病、维生素K缺乏等出血性疾病人，本身需要就需要少食或者禁食鱼，而多宝鱼的鱼肉中所含的二十碳五烯酸，会抑制血小板凝集，食用后加重出血性疾病患者的出血症状。
痛风患者禁食。多宝鱼中含有大量的嘌呤类物质，而痛风则是由于人体内的嘌呤代谢发生紊乱而引起的，食用后会造成病症加重。
空腹不能吃多宝鱼。空腹食用多宝鱼，在没有足够的碳水化合物来分解的情况下，大量的嘌呤会造成人体酸碱平衡就会失调，容易诱发或者加重痛风的病情。
不能食用未煮熟的。多宝鱼属于海洋生物，体内会在有寄生虫，在没有熟透的情况下食用，会导致人体感染寄生虫。因此在烹饪的时候，一定要使多宝鱼的鱼肉为易剥落和嫩滑的状态，且肉质没有没有任何半透明的迹象。
不要过度油炸。多宝鱼中本身含有大量的蛋白质和脂肪，将多宝鱼油炸后食用，或者与高脂肪、高热量的酱料搭配食用，会导致人体摄入大量的脂肪，不但会失去多宝鱼原有的风味，还会导致人发胖。