花蛤壳内的东西都是可以吃的，但在生活中，很多人会选择不吃蛤蜊肉中的黑色部位。需要注意的是花蛤在烹饪之前，应将花蛤中的细小沙粒清除干净，避免影响口感。
蛤蜊肉中的黑色部分是蛤蜊的内脏，也被称为黄，具有一定的营养价值，但是含有的胆固醇含量也比较高。蛤蜊的内脏受蛤蜊体积的影响较为聚集，而且会含有少量没完全消化的泥沙以及排泄物，因此不建议食用。
通常，在烹饪蛤蜊前，会直接将蛤蜊的黑色部分去除掉。但难免会有清除不干净的情况，就需要在烹饪前先用海水将蛤蜊浸泡一段时间，让蛤蜊将身体中的沙粒吐出。如果没有海水，就不需要这个工序，只需要颠一颠蛤蜊，然后清洗干净就可以了。
虽然花蛤壳内的所有部位都能使用，但是已经死亡的蛤蜊是不能食用的，以免出现身体不适的症状。买回家的蛤蜊在判断新鲜程度的时候，可以用温水焯蛤蜊，鲜活的蛤蜊用水一焯就会张开，而焯水后不开壳，或者开壳后肉是两边都挂着不容易掉下来的，是已经死亡的蛤蜊，不能使食用。