ITS鉴定指什么,测序得到了一真菌的ITS序列,怎么确定是什么菌
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ITS序列是指真菌rDNA上的5.8s,18s和28srDNA序列之间的转录间隔。5.8s,18s和28srDNA序列进化上高度保守,而ITS序列由于选择压力小,在自然中变异较快,在绝大多数真菌中表现出序列多态性,表现为种内相对一致,种间差异比较明显,非常适合真菌鉴定以及系统发育分析。由于ITS鉴定快速,分析准确,有效弥补了传统鉴定方法的不足,得到了广泛应用。
利用ITS序列分析可以实现对多数品种真菌的快速准确鉴定。鉴定中无需反复培养进行生理生化反应和实验,极大缩短了鉴定周期和鉴定准确度。
鉴定步骤包括:
* 提取微生物样品DNA
* 扩增出真菌ITS区序列
* DNA测序,将样品序列与GenBank中已知序列进行比对
* 判定微生物种类,可将微生物划分到属或种
* 与同源性较高菌种构建系统发育树
网友回答
Blast比对序列,看看和那个物种匹配度最高