小米9 Pro 5G手机内置了MIUI 11系统，这款操作系统将会为用户带来更好的使用体验。
MIUI 11拥有成熟完善的现代化设计，去除冗余视觉符号，为触控精心设计的交互控件，理性用色使内容一眼识别，让内容和你直接沟通。
MIUI 11中首次搭载了动态字体系统，文字粗细无级调节，每个人都可找到适合自己的字重。智能加粗还会根据内容层级和重要性予以文字不同程度加粗，使阅读体验更为极致。
MIUI拥有全新动态息屏，这是一个非常有趣的应用，从体现光线之美的百变万花筒，到表达数理韵律的波点表盘，原本静止的图案都在息屏上绽放，精致得如同艺术品。用息屏显示彰显你的个性与态度，不仅文字可自定义，一切均可随心所欲。
不仅如此，手机来电时或者来通知时会收到全新的光效通知，MIUI 11中可选用息屏呼吸光效来提醒，不仅低调，而且看起来也很酷。
同时铃声音量会变得非常好听，自然界中美妙生灵的发声成为了MIUI 11的通知音，每一次聆听都美妙无比；同时随着一天时间变化而改变，完美融入环境。
小米互传功能可以实现高速跨平台之间互传文件，跨手机品牌支持与OPPO、vivo手机。需要注意的是，该功能仅支持Android P及以上版本手机（不包含红米6pro、红米6、红米6A、Redmi 7A、Redmi 7、红米S2、小米CC 9e），OPPO及vivo支持跨品牌互传。
不仅如此，手机与电脑之间也可以实现互传，您只需要轻点分享，搜索到的周围的小米笔记本，即可将文件发送至电脑，无需安装任何应用。电脑发送文件给手机也一样简单。