标志着君主专制制度发展到顶峰的是：D
A. 在中国历史上延续了一千多年的宰相制度被废除
B. 明万历初年，内阁首辅张居正当权时“部权尽归内阁”
C. 清康熙帝时，内阁、议政王大臣会议与南书房三足鼎立，互相制约，最后集权于皇帝
D. 设置了直属皇帝的具有传达性质的中央机构——军机处
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A. 在中国历史上延续了一千多年的宰相制度被废除
B. 明万历初年，内阁首辅张居正当权时“部权尽归内阁”
C. 清康熙帝时，内阁、议政王大臣会议与南书房三足鼎立，互相制约，最后集权于皇帝
(答案→)D. 设置了直属皇帝的具有传达性质的中央机构——军机处
解析：丞相制度被废除后明成祖设立了内阁制度，但此时的皇权并没有达到顶峰，所以排除AB两项。C项表明皇权是弱的，所以排除C项。故答案选择D项。