在维吾尔等族人民的支持下，清军平定了大小和卓的叛乱。清朝为加强对西北地区的管辖设

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B解析在维吾尔等族人民的支持下，清军平定西北天山以南的大小和卓叛乱后，清朝设置伊犁将军府机构，管辖包括巴尔喀什湖在内的整个新疆地区。清朝军队驻扎新疆各地，设置哨所，加强对西北地区的管辖。故本题选B。