人类现在只有智人种的话，是不是北京猿人（直立人）和我们并没有血缘关系？

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不同种之间存在生殖隔离，并不能说没有血缘关系。亚种之间不一定有生殖隔离。就像可以杂交的狗，它们只不过是地理隔离或人工育种出的亚种罢了。