在香港机场登机去海外，签证国家跟机票上的目的地不是一个地方，办理值机手续时有麻烦吗？

在香港机场办理登机手续时，工作人员会检查签证跟机票目的地是否一致吗？比如我的签证是马来西亚，机票是香港到南非（落地签），这个在香港机场办理值机手续时有问题吗？