引物设计时候,关于△G方面的用Primer5设计引物时,遇到引物二聚体,交叉二聚体、发卡结构,错配等方面,△G有选择的范围吗?大概在什么范围内比较好?而且一般,△G的数值前面都有个“—”号,是放出能量的意思吗?选择时候只考虑绝对值吗?本人菜鸟一枚, 生物
网友回答
【答案】 △G值是指DNA 双链形成所需的自由能,它反映了双链结构内部碱基对的相对稳定性,△G值越大,则双链越稳定.实验表明,待扩区域自由能(△G°)小于58.6l kJ/mol时,扩增往往不能成功.
其实这些因素确实是需要考虑的,实验表明,待扩区域自由能(△G°)小于58.6l kJ/mol时,扩增往往不能成功.但都是预测性的,也不用过分注意,有些引物设计的时候无法避免有二聚体,但是我们可以优化PCR的反应条件,基本都可以扩增出目的基因的.