如果注册会计师证实被审计单位（上市公司）连续两年财务报表是亏损的经营业绩，则在第三年审计年度的财务报表审计中，注册会计师应当将发生认定作为重点审计的财

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参考答案：A
参考解析：选项A正确。因为被审计单位（上市公司）已经连续亏损两年，如果第三年当年财务报表显示的结果是继续亏损，则其股票交易将面临特别处理。因此，被审计单位管理层希望能够改变亏损的情形，注册会计师需要考虑被审计单位是否有高估资产和收益、低估负债和费用的重要错报领域，故营业收入的高估风险最重大。