如上
网友回答
现在一般把日本僧人的“肉食妻带”现象视为是明治时期的太政官令影响，实际上这是不全面也不准确的。
从几个方面来简单回答一下
1，流派之分：
日本佛教传统来讲有十三宗五十六派之分，全国有80%的人自认为是佛教徒，其中大部分属于净土真宗，禅宗和真言宗信徒也不少。
先简述一下日本佛教的历史：佛教在飞鸟时代（6世纪)左右传入日本，当时传入的是南北朝时期流行的成实宗（起源于鸠摩罗什，玄奘就是最有名的成实宗僧侣之一）和三论宗（实际上也起源于鸠摩罗什，后来自高丽兴起，反传入南朝）。成实和三论都属于空宗，不能说不重视戒律，但并不把持戒作为首要。
之后到了奈良时代，佛教管理制度开示完善，国家也建立了官寺，有了僧官制度，这个时候有了南都六宗的说法，即除了之前的成实三论之外，还多了玄奘创立的法相宗，以俱舍论为经典的俱舍宗，专研华严经的华严宗，和重视戒律的律宗。
这里重点讲下律宗。八世纪初，鉴真东渡日本，并把四分律这个概念带入，比丘要受250戒，而比丘尼则受348戒。当时的日本因为对僧人有劳役等优待条款，所以很多人自称出家，实际上只是借此来逃过税负劳役而已，所以鉴真提出的戒律以及对僧团的管理获得圣武和孝谦天皇的认可，经过和本地僧人一番辩论之后，确定了具足戒需要三师七证的条件（就是说要正式出家必须得有十位戒师在场及认可，不是说自己在家说一下我要出家就成僧人了= =），并在东大寺起戒坛为皇族集体授菩萨戒。后来孝谦失势，淳仁天皇上位，虽然不怎么待见鉴真，依然为他建立了唐招提寺，规定日本僧人在受戒前必须在唐招提寺学习戒律 --- 这段时期是日本律宗最盛之时。
之后到了平安时代，迁都平安京，又把空海和最澄送出去留学，当时开元三大士由印度来到天朝弘法，恰是密宗最盛时候，所以这二位学到的都是唐密。回国之后，空海在高野山创立了真言宗（东密）而最澄则在比睿山创立了天台宗（台密），与奈良的旧佛教分道扬镳，真言和天台并称平安二宗。
此时奈良一方，自鉴真涅槃之后，律宗也逐渐式微，当时最盛的乃是秉持唯识观的法相宗，简单来说，就是空宗的相反，否认一切皆空。而最澄在留学前本来是三论宗的僧人，留学回来之后花费了数年时间和当时的法相宗高僧论法，进行空有之辩 （这个下面详说），最终算是最澄占了上风，至此南都六宗逐渐式微。
大概同一时期最澄引入了一个观点：圆顿戒。又称一乘戒。简单来讲，就是把原本的二百五十戒简化到十重四十八轻戒，并主张设立一乘戒坛，取代本来的律宗戒坛，这件事情遭到当时南都（即奈良）方的强烈反对和抨击。---- 关于一乘戒的详细在下面说。
最澄以及天台宗争取了很久，最后在最澄入寂之后七天，朝廷终于设立了一乘戒坛，至此为止日本佛教对守戒的态度又为之一变。
之后平安时代末期，世道纷乱，向往死后极乐世界的净土信仰开始在日本上层社会流行，当时的关白藤原赖通（就是有名的藤原道长长子）在京都出家，并建立了平等院，由天台宗分化而来的净土宗逐渐兴起。
到了镰仓时代，日本佛教逐渐入世，在上层社会禅宗开始流行，喜欢坐禅论道和谈论公案的临济宗以及只管打坐的曹洞宗传入；而中下层阶级则多信以念“南无阿弥陀佛”为主的净土宗和念诵“南无妙法莲华经”的日莲宗。后来又有看重“一念发起，恶人正机”的一向宗/净土真宗和鼓励信徒边唱边舞边走边念佛的游行宗。统称为镰仓新佛教六宗。
那么到了这个时候，以唐招提寺为主的律宗已经成为一个很小的派别了，期间真言宗又分化出来看重密宗金刚乘戒律的真言律宗，以及禅宗内部的禅律，并称为北京律和南都律。（这里的南北之分是奈良和京都= =）
那么到此为止，基本上镰仓新佛教的诸派都是以最澄的一乘戒为主了，当然其中还有更松懈的，比如净土宗就认为念佛本身才是最重要的，高于遵守戒律。
到了室町时代，镰仓幕府灭亡，镰仓新佛教也步向衰落。从禅入玄的临济宗逐渐在上层社会一枝独秀，有了京都五山之说。同一时期，因为只需要打坐默思，所以曹洞宗则为平民广泛接受。净土真宗的信徒也非常多。
进入战国时代，天台宗的分支日莲法华宗完全在京都大盛，称为“京都中皆法华”，引起了法华宗另一派比叡山延历寺的强烈不满并爆发了十余年的宗教战争，卷入了诸多大名，称为法华一揆。再加上信长支持净土宗而非日莲，于是天台流派也开始衰落。而净土真宗，因为本愿寺的关系，一开始虽被信长打压，后来经过家康支持，又成立了西本愿寺，才逐渐重新兴盛起来。
然后到了江户幕府，终于有了寺请制度，最不重视戒律的净土真宗至此成为日本最大佛教流派。
2，最澄和亲鸾的 “无戒律之佛教”是什么
谈这个之前先要说佛教的三种受戒方式：大小兼受戒，菩萨戒和无戒之戒。
所谓的大小兼受戒，也就是说同时要守南传的声闻戒和北传的菩萨戒，两者的最大区别是声闻戒是“从他受戒”，只能照上面提到的，由十位戒师授戒，看重僧团戒律，外戒和修戒（一边修行一边持戒）；而菩萨戒则承认“自誓受戒”，只需要有一位戒师在场即可，并向菩萨起愿，看重自律，内戒和本性戒。在具体方面又有二百五十戒和十无尽戒大概这样的区别 （答主不是非常了解南传说得不对的请 @暗香浮动月黄昏 老师指点）。目前来讲天朝所有的显宗寺庙理论上都是这种。
而菩萨戒则是不需要受声闻戒。最澄当时倡导设立一乘戒戒坛时候声明：
自今以後，不受聲聞利益，永乖小乘威儀，自作誓願，棄二百五十戒，依菩薩威儀，開大乘戒。
无戒之戒是亲鸾提出的，强调的是“一念发起”的忏悔观和救赎“恶人正机”的绝对他力。用简单的话来说，就是放下屠刀立地成佛。
那么最澄是否真的反对守戒律呢？
他在【天台法华宗年分学生式】里提到：
凡法華宗天台年分，自弘仁九年，永期于後際，以爲大乘類。不除其籍名，賜加佛子號，授圓十善戒，爲菩薩沙彌。其度縁請官印。
凡大乘類者，即得度年，授佛子戒爲菩薩僧。其戒牒請官印。受大戒已，令住叡山一十二年，不出山門，修學兩業。
从这里可看出来，受了菩萨戒的僧人，要在比叡山呆12年不能下山，修习两业（遮那业和止观业）。
在这之前，受律宗戒的僧人，之前可以先受简单的十戒成为沙弥，然后修习数年，满20岁就可以受具足戒，所以最澄的看法大概是，与其给不知道修行水平的僧人受戒，还不如直接让他们直接受菩萨戒，然后关起来闭关修行= =
对能修行到什么地步又有描述：
凡兩業學生。一十二年。所修所學。隨業任用。能行能言。常住山中 衆之首 國之寶。能言不能行 國之師。能行不能言 國之用。
而在修行完成之后又如何呢，最澄提出应该把佛寺分为三种：
凡佛寺有三：
一者、一向大乘寺。初修業菩薩僧所住寺。
二者、一向小乘寺。一向小乘律師所住寺。
三者、大小兼行寺。久修業菩薩僧所住寺。
今天台法華宗年分學生，並回心向大初修業者，一十二年，令住深山四種三昧院。得業以後，利他之故，假受小律儀，許假住兼行寺。
那么也就是说，说来说去。。。尽管他贬义性的称南传为小乘，又说是“假受”，实际上还是承认了守完整戒律的重要性。
至于亲鸾，肉食与妻带这两个方面是不能相提并论的。
首先谈食肉，食肉本身实际上是不违背佛教原始教义的，亲鸾以四分律和五分律为依据，提倡“十不净肉和三净肉”，并认为说提倡素食的提婆达多是佛教叛徒，素食没有道理。
以三净肉而言，就是“不见为我故杀。不闻为我故杀。若不见家中有头脚皮毛血。又彼人非是杀者”，南传佛教也可食用，所以答主本人认为用这个来非议亲鸾是不客观的。
娶妻则确有其事，亲鸾的妻子后来也成为比丘尼（惠信），而亲鸾提倡的教义就是绝对他力，亦即自己本身不需要做任何事情，只要信仰+念佛，由佛力本身来超度自身。
所以总结来说就是，最澄和亲鸾对戒律的看法并不能混为一谈，出发点也不一样 （虽然说最澄的确对后来的日本佛教有巨大影响）。
3，一乘和三乘的争论
真正让最澄对亲鸾形成传承关系的，其实是之前提到的，天台和法相宗关于一乘和三乘之争。简单说，一乘就是说人人皆能成佛，而三乘则认为众生具有五性（声闻定性，缘觉定性，不定性，菩萨定性和无种性），经过修行之后，根据个人修行境地不同，可以达到菩萨，声闻及缘觉位阶。
最澄当时引用了法华经里面的即身成佛故事，并用龙女作为比喻，认为只要发菩提心，众生皆有成佛的机会。
这种看法到后来深刻的影响了亲鸾，并进一步引申到罪人只要忏悔发心也可得道，佛法普度众生自然愿意拯救有业障的人即“恶人正机”说。
4，寺族和僧人的区别
那么具体到日本对僧人娶妻过世俗生活的层面，必须先澄清下几个概念：
寺族：家业相续，世代掌管寺庙的家族 （就是题主说的“父亲是某寺庙和尚”这个情况），
坊守：寺族制度里住持的妻子，90年代之后，净土真宗也认可女性住持了。
坊主：寺族制度里的住持，净土真宗的住持也可称为院家
现在一般来讲，即使是根据最不看重戒律的本愿寺说法，这些人都算居士而不是比丘。严格来讲，更属于寺庙的管理者，或者类似于神官。
而非寺族制度里的住持是称为和尚，方丈，阿阇梨，大本山的住持称为长老，门主，管长等。
5，目前日本佛教各宗派对僧人结婚的看法
净土真宗：承认寺族制度和继承制，但并不是住持的儿子能自动成为住持，一开始先称为末教师众徒，然后进入大学学院进行3-5年的宗教史和佛法学习，然后成为教师众徒，然后去考资格试（据说很严格），考过了称为【教师】，到此时才有资格继承住持 （称为住职继承。
真言宗：对寺族制度的态度是承认，但坊主不可以弘法和收徒，提倡守戒。
曹洞宗：把寺族本身和僧侣划分开来，坊主可以弘法，不可以收徒，持戒程度介乎于净土和真言宗之间。
各派律宗：依然严格守戒中。
但是无论哪个派别，世袭制的行为也只发生在民间的末寺里面，大部分的大本山僧团都是严格遵守声闻戒+菩萨戒的。
利益相关，答主是高野山真言宗信徒。