人类是进化来的，那么灵魂也随之进化吗

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举个形似，但是是错的例子。就如一颗糖和一杯水，把糖放入水中，糖会溶解在水中形成糖水，把这杯糖水蒸发后，糖就会重新出现（严格的说，这时的糖不再是放如水中之前的糖，因为至少形状改变了）。糖便是灵魂，水便是这世界或者身体，之后得到的糖就是人死后灵魂。但是糖水不是灵魂，不是这个世界的存在（身体），也不是灵魂和身体，而是人的感情（比如因为伤心而心痛，有灵魂形成的感情，也有身体自身形成的，比如贪吃，也有灵魂和身体共同形成的，比如矛盾，这几个例子不是与前面的原因一一对应的，前面的原因可以形成后面，后面的例子不一定就是前面的原因导致的）。所以就如你所说的，移植器官多少会改变人的性（这是改变的原因之一，能改变人的原因挺多，但是万变不离其宗）。